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转录组学与代谢组学一样不(转录组和代谢组关联分析)

转录组学与代谢组学一样不(转录组和代谢组关联分析)

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  1. 基因组,转录组,蛋白组有什么区别,相互关系是咋样的
  2. 与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有何优点
  3. 四大组学如何筛选分子标志物

1、基因组,转录组,蛋白组有什么区别,相互关系是咋样的

转录组通常可认为是基因组的简化研究手段,即所有转录本的集合。蛋白组:生物体基因组所编码的全套蛋白质。

在基因解码知识体系中,基因组是一个个体内全部基因信息组成的总称、而转录组是指具有相对性,可以是一个个体在某一时间、某一条件下的全部转录产物的总称。

区别:基因是遗传物质.蛋白质组是基因组的表现形式。基因组,一般的定义是单倍体细胞中的全套染色体为一个基因组,或是单倍体细胞中的全部基因为一个基因组。

通过比较不同物种的基因组序列,我们可以了解它们之间的演化关系、共同祖先以及基因家族的扩张和收缩等信息。生物信息学中用于基因组演化研究的方法包括序列比对、基因家族聚类、系统进化分析等。

转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集合。

2、与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有何优点

相对于传统芯片而言,转录组测序无需预先设计探针,即可对任意物种的任意细胞类型的转录组进行检测,能够提供更精确的数字化信号,更高的检测通量以及更广泛的检测范围,是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。

代谢组学.基因组学研究的主要是基因组DNA,使用方法目前以二代测序为主,将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装,当然这仅仅是第一步,随后还有繁琐的基因注释等数据分析工作。

尽管还没有经典论文出现,但是研究人员相信,与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学将在临床上发挥更大的作用。

代谢组学是基因组学、转录组学和 蛋白质组学 的下游补充,提供生物系统生理状态的总体评估。它代表了遗传调节的终点及其对细胞中酶活性和内源性生化反应变化的影响。

3、四大组学如何筛选分子标志物

验证上述筛选出的生物标志物组,或选择特定的生物标志物组,计算区分效果(AUC)值。可以从构建的最佳生物标志物组中进一步选择样本进行验证,也可以手动选择生物标志物组进行分析。

二维凝胶电泳(2DE):2-DE 是一种比较常见的蛋白质分离和纯化技术,能够将复杂的蛋白质混合物进行高效分离,并且能够定量检测不同样品中蛋白质的差异表达。

随着现代分子生物学和细胞生物学在癌症研究中的广泛应用,癌症的发生机制正在逐渐被揭示。癌症的早期诊断和早期治疗呼唤灵敏、特异的肿瘤标志物的发现,研究癌症相关蛋白的修饰由于可能导致发现新的特异抗癌药物靶蛋白而备受关注。

MALDI的基本原理是将分析物分散在基质分子(尼古丁酸及其同系物)中并形成晶体,当用激光(337nm的氮激光)照射晶体时,基质分子吸收激光能量,样品解吸附,基质-样品之间发生电荷转移使样品分子电离。

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