本篇文章给大家谈谈代谢组学的热图怎么看，以及代谢组学数据对应的知识点，希望对各位有所帮助，不要忘了收藏本站喔。 今天给各位分享代谢组学的热图怎么看的知识，其中也会对代谢组学数据进行解释，如果能碰巧解决你现在面临的问题，别忘了关注本站，现在开始吧！

1. 深度空间代谢组学QA(三)| 常规分析内容及数据清洗策略
2. 宏基因组,代谢组:高分文章中物种与代谢物相关性热图是怎么画的?
3. R数据可视化5:热图Heatmap

1、深度空间代谢组学QA(三)| 常规分析内容及数据清洗策略

空间聚类分析（Segmentation）空间聚类分析的本质是一张空间聚类分析的热图，通过聚类算法后，对有相似代谢模式的区域使用同一种颜色标注，清晰直观的从分子层面对切片进行区域分型。

代谢组学（metabonomics/metabolomics）是效仿基因组学和蛋白质组学的研究思想，对生物体内所有代谢物进行定量分析，并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究方式，是系统生物学的组成部分。

公司介绍：苏州帕诺米克（BioNovoGene）最早是做基因检测服务的，2017左右聚焦做代谢组学，改名为诺米代谢（PanoMIX），公司2021年获得元生创投亿级融资。

基因编辑：基因编辑技术，特别是CRISPR-Cas9技术，已成为生命科学领域的一个重要工具。它可以准确地更改基因序列，对于治疗遗传性疾病、创新农业生产和研究动植物等领域都具有巨大的潜力。

2、宏基因组,代谢组:高分文章中物种与代谢物相关性热图是怎么画的?

如上图所示，每一列代表一个样本，每一行代表一个基因，颜色代表表达量（这张图的图例看出，颜色越偏红色，数值越大，基因表达量越高）。 热图还可用于展示其他物质的丰度，如某细菌的相对丰度、代谢组不同物质的含量。

分 宏基因组即生境中全部微小生物遗传物质的总和。

宏基因组和宏转录组中的生物功能在有很高的一致性【下图】；4）个体间的稳定性：宏基因组 宏转录组 微生物群落；5）多数基因在RNA水平上的变异 DNA水平上的变异。

[代谢组学与 16S 的检测主要是物种类别或者丰度与代谢产物丰度的关联。而宏基因组与代谢组学的关联主要是其代谢通路与基因功能和代谢产物的关联。

另一种策略：two-tiered approach，即挑取少部分样本，既做 16s rDNA 测序，又做 shotgun metagenomics 测序，对比这两个层次的结果来评估实验结果的稳健性。

3、R数据可视化5:热图Heatmap

heatmap.2函数和我们之前要求的数据类型不太一样，这个函数输入数据要求是个矩阵（matrix）。

热图（Heatmap）：用颜色变化直观的表达数据之间差异的图，是对实验数据进行质制和差异数据的展现，是数据挖掘类文章的标配。

假设我们有如下数据 要绘制简单的热图，可以使用内置的 heatmap 函数 更改颜色，并为列添加列样本的分类颜色条 内置函数提供的样式较少，无法对某些图形属性进行设置。

我们可以比较一下pheatmap和Heatmap的结果 如果数据当中含有缺失值，如果我们不想去掉想要可视化的话，可以通过na_col来指定颜色 通过上图，我们可以使用对热图的四周都可以进行标题注释。 无监督的聚类属于热图的可视化的一个重要组成部分。

到此，以上就是小编对于代谢组学的热图怎么看的问题就介绍到这了，希望介绍关于代谢组学的热图怎么看的3点解答对大家有用。